现代物流学院成立于2014年，是学院第一批开设高职专业的院系。现开设有现代物流管理（2021）、电子商务（2021）、大数据与会计（2014）、大数据与财务管理（2016）4个专业。现代物流学院坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，以“探求经管新知、传承工匠精神、培育技能英才、助力区域发展”为使命，坚持“产教融合”“德技并修”，奋力朝着服务区域经济、培养高素质技能人才，形成特色鲜明专业群的目标加速迈进。

现有在校生1141人、校内专职教师42人、辅导员6人；其中：硕士研究生12人、副高及以上8人。建有校内实训室24个，总面积3645m²，设备总价值超1500万元。先后与新疆顺丰速运有限公司、新疆交通投资（集团）责任有限公司哈密分公司、新疆新雅葡萄酒业有限公司、哈密瓜鲜果品牌运营有限公司、新疆成福联合会计师事务所等10余家行业领军企业签订校企合作协议，共建校外产教融合实训基地。为师生搭建了良好的社会实践服务与教学科研平台，就业率连续三年在90%以上。